Si lo veo bien, el tramo aislado es el que está bajo la locomotora (bajo la escalerilla) en la primera foto, ¿no?
En tu primer esquema pones que la alimentación desde la caja negra del multimaus está a la izquierda, pero parece que no es así.
Si al carril situado a la izquierda del tramo aislado no recibe corriente, el tramo aislado no lo recibirá, esté el interruptor en verde o en rojo, en verde conectará los dos carriles, el aislado y el de la izquierda, pero lo dicho, si este no recibe alimentación, la locomotora se parará, sí o también
Esto es fácil de ver, con el interruptor en rojo, si pones la locomotora a la izquierda del carril aislado, debería marchar.
Por cierto, con ese pupitre y sector aislado yo tantearía el poner un freno
ABC, de esa manera las locomotoras en contramarcha (esto es, de derecha a izquierda) no se pararían en el sector aislado.
Un saludo.