Hola buenos días Baracaldo,
Como he comentado en mi blog
http://treneslonginos.blogspot.com.es/2013/08/conexion-digital-desvios-roco-geoline.html, mas que el voltaje que proporciona un transformador (16V-18V), lo que necesitas es un transformador que te de mas amperaje, estos motores con 1Ω van muy cortos.
Dependiendo de donde este ubicado el transformador y del grosor de los cables eléctricos que hayamos usado para nuestra instalación, puede darse el caso que no llegue al motor todo el amperaje que ofrece el transformador, por eso, en un sentido si que mueves el desvío pero en otro no.
Para descartar posibles problemas, prueba un motor conectado con cables de 1,2mm y lo conectas cerca del transformador y ya nos comentas cual es el resultado.