Con el lavavajillas, por supuesto
Ahora en serio, yo lo que hago una vez desmontada la carrocería es usar según crea conveniente una brocha, un cepillo de dientes o un trapo. Si algo se me resiste uso el trapo con un poco de alcohol. Cuando he comprado locomotoras de 2ª mano muchas veces he tenido que desmontar completamente los engranajes y el motor para hacer una buena limpieza a fondo, pero sin mayores complicaciones. Después engraso y a funcionar.
Yo para el engrase uso 3 en 1, aplicándolo con cuidado para no poner demasiado. Muchas veces uso un palillo para poner un pelín de aceite justo donde lo necesito.